レミー中心に物語が展開するテレビシリーズの後日談である。ドクーガとの戦いが終結してから40年後、レミーは病魔に冒されていた。真吾とキリーに再会すべく博物館へ急ぐレミーは事故に巻き込まれ危篤に陥る。元々病魔に冒されていてさらに重傷を負ったレミーは生存率は1%もないと医者から宣告される。レミーを案ずるかつての仲間たちを傍らに、病床のレミーは精神内の不思議な街で仲間と共に逃れられない自分の運命と戦っていた…。
宇宙戦国時代を迎えた2001年。地球を支配しようと企むドクーガの勢力と、地球を守るグッドサンダーの勢力が激しい攻防を繰り返していた。そこに新しい敵サントスが出現、地球の未来は?... 第17話と第20話を中心に作製された番外編。
2001年、国際社会に巧妙に根を下ろし、全世界を掌握せんとする悪の秘密結社ドクーガに、謎の男サバラスに率いられたグッドサンダー部隊が挑む。その面々が乗り込む移動要塞「グッドサンダー」は謎のエネルギー「ビムラー」が動力源であり、最大 1万kmの距離を瞬間移動できる。だがドクーガも「ビムラー」を狙っていた。